Переключиться • 31 июля 2024

Как биоинженеры изменили мир: как генетически модифицируют вакцины и создают лабораторные бургеры

Как биоинженеры изменили мир: как генетически модифицируют вакцины и создают лабораторные бургеры

Текст: Наташа Покровская


Синтетическая биология, наука о переписывании генетического кода, уже дала миру мРНК-вакцины и выращенное в лаборатории мясо. Она сулит решения глобальных проблем: от изменения климата до нехватки еды. Но за прогрессом скрываются и опасности. Допустимо ли создавать генетически модифицированные организмы? Как защититься от кибербиологических угроз? Что, если военное применение синтетической биологии приведет к массовому вымиранию? О том, как эта наука меняет мир, рассказывают Эми Уэбб, футуристка, профессор стратегического прогнозирования в бизнес-школе Нью-Йоркского университета, и один из основоположников синтетической биологии, сооснователь компании Humane Genomics Эндрю Гессель в своей книге «Машина творения: Новые организмы, редактирование генома и лабораторные гамбургеры». Книга вышла в издательстве «Альпина нон-фикшн». Inc. публикует ее отрывок.

Альпина Нон Фикшн

В конце 2019 г., когда китайское правительство предпринимало активные попытки преуменьшить масштабы проблемы с появившимся в тот момент и чрезвычайно опасным новым коронавирусом, доктор Чжан Юнчжэнь, вирусолог Шанхайского государственного медицинского центра, испытывал в связи с этим загадочным патогенным организмом все большую озабоченность. К тому времени на счету его исследовательской группы уже было более 2000 выявленных вирусов, но особенности нового коронавируса, бушевавшего в Ухане, всего в восьми часах езды к западу от их лаборатории, вызывали тревогу.

Добрый доктор

Помимо многих других причин основанием для тревоги был и тот факт, что заражение могло произойти за 10‒14 дней до проявления симптомов болезни. Чжан опасался, что в случае промедления с принятием мер со стороны правительства инфекция стремительно распространится от людей, находящихся в Ухане, — китайских граждан, иностранных рабочих и туристов — в те места, куда они поедут. Как и многие другие китайские лаборатории, которым было известно о новом возбудителе, Чжан с коллегами приступили к определению последовательности коронавируса.

Благодаря обширному опыту в открытии новых вирусов и современным технологиям команда Чжана расшифровала геном всего за 40 часов. Как и предполагали ученые, патоген напоминал вирус тяжелого острого респираторного синдрома (SARS), который свирепствовал во многих странах в 2003 г.

Правительство Китая тянуло с признанием опасности, а Чжан тем временем оценивал личные и политические последствия обнародования результата расшифровки в сравнении с сокращающейся возможностью остановить распространение вируса. К счастью для всего мира, долго ждать он не стал. 5 января 2020 г. Чжан опубликовал последовательность в базе данных GenBank, которая, по сути, представляет собой биологическую «Википедию». Исследователи размещают в ней установленные ими генетические последовательности и аннотации к ним. Модераторы сообщества рассматривают присланные сведения и в случае их одобрения публикуют. (Как и в случае с «Википедией», денег за такую работу по расшифровке последовательностей не получает никто, однако в выигрыше остаются все).

Но Чжана беспокоило, что даже этот процесс, на который уходит гораздо меньше времени, чем на публикацию в традиционных рецензируемых журналах, все равно окажется слишком долгим, чтобы донести информацию. Поэтому он обратился к своему другу из Австралии и попросил его опубликовать сообщение на virological.org, гораздо более свободном от администрирования дискуссионном сайте. Представьте себе Reddit, только для вирусологов. 10 января 2020 г. сообщение появилось в Сети и моментально активизировало безотлагательные меры со стороны GenBank.

Шар с шипами

Несколькими днями позже в Кембридже (штат Массачусетс) предприниматель Нубар Афеян, сидя в ресторане за ужином в честь дня рождения дочери, получил эсэмэску от генерального директора его собственной фирмы Стефана Банселя. Афеян основал компанию Moderna, на тот момент еще малоизвестную, в названии которой сочетаются слова «модифицированная» и «РНК» (RNA), с тем чтобы переконструировать матричную РНК с помощью методов синтетической биологии для создания индивидуальной противоопухолевой терапии. Технология функционировала в условиях лаборатории, но не привела к появлению товарной продукции, поэтому специалисты компании переключились на моделирование мРНК для различных методов лечения: разрабатывали новые биты кода, чтобы научить клетки человека выполнять новые функции, такие как выработка антител и заживление тканей.

Афеян поспешно вышел на улицу и перезвонил Банселю. Тот был в курсе развития событий вокруг последовательности Чжана и знал, что погоня за противовирусными препаратами и вакцинами уже началась. Он попросил разрешение отвлечь средства, выделенные на 20 препаратов, находящихся у Moderna на стадии разработки, и перенаправить их на создание мРНК-вакцины против нового вируса. Опыта у компании было достаточно: Moderna в течение многих лет сотрудничала с NIH в работе по созданию прототипов вакцин на основе мРНК против коронавирусов. Однако ни одну из этих вакцин на рынок еще не вывели, а у Moderna не было лишних денег, чтобы развернуть полномасштабную программу по созданию препарата с нуля. Несмотря на риск Бансель чувствовал, что затевается что-то важное, и Афеян согласился. «Действуй», — сказал он.

Работая с последовательностями, опубликованными Чжаном в GenBank, Moderna начала создавать последовательности РНК для шипикового белка коронавируса. Как известно, внешне этот вирус напоминает покрытый шипами шар. По опыту предыдущих исследований специалисты команды знали, что именно эти шипиковые белки, скорее всего, вызовут ответную реакцию: иммунная система человека, как правило, фокусируется на крупных, заметных признаках. По сути, разработанная компанией вакцина должна была действовать как биологический плакат с надписью «Разыскивается опасный преступник! Шар, покрытый шипами! При обнаружении — убить на месте!».

Moderna уже выполнила основную часть нелегкой работы, например выяснила, как направить эту мРНК во внешнюю область клеток, цитоплазму, где строятся белки. Вне клеточного ядра мРНК должна создавать временную базу, переводить собственную строку букв в белок и сразу после этого удаляться. Это подтолкнет клетки к производству безопасных компонентов коронавируса, чтобы запустить работу иммунной системы. Затем мРНК разрушается, а дальше организм борется сам, используя собственные защитные механизмы.

Эксперимент удался

С помощью специально разработанных инструментов ученые искали в генетическом коде определенные особенности: включатели и выключатели, последовательности нуклеиновых кислот, помечающие конец гена во время транскрипции, и наборы инструкций, которыми определяются точки запуска и остановки для различных белков. Разница между SARS-CoV-2 и другими коронавирусами заключается всего лишь в 12 дополнительных буквах генома: CCU CGG CGG GCA. Именно эти 12 букв делают его таким вирулентным. Они обеспечивают активизацию шипикового белка и его вторжение в клетки человека. Но мРНК способна доставить в клетки набор инструкций, нацеленных на эту строку букв и останавливающих атаку вируса. На разработку этого кода ушло всего два дня.

Такой подход — с использованием синтетической РНК — гораздо более эффективный и адаптируемый, нежели старые протоколы вакцин, например основанные на ослабленных вирусах или, как в случае с ежегодной вакцинацией против гриппа, требующие миллионов яиц для производства необходимого количества доз. По сути, Moderna создавала генетические инструкции, которые можно написать, как компьютерную программу, и упаковать в наноскопического размера аналоги USB-накопителей. После введения этих биологических USB-накопителей в клетки последние послушно выгружают инструкции мРНК и следуют им.

К тому же такие вакцины более безопасны и их проще контролировать. В отличие от генной терапии, которая может вызвать постоянные или даже передающиеся по наследству генетические изменения, мРНК действует в наших клетках совсем недолго. Генерирующая вакцину программа работает в течение непродолжительного времени и саморазрушается.

Moderna совместно с биотехнологической компанией BioNTech наконец-то нашла реальное применение тому, что все считали труднореализуемой, фантастической технологией. Но вакцины, которые есть сегодня в нашем распоряжении, были бы невозможны без многолетних достижений в развитии техники и технологий, лежащих в основе процессов синтетической биологии. Все эти технологии, машины, вспомогательные системы и то, что они производят, составляют биоэкономику: процессы производства и потребления, связанные с синтетической биологией и вытекающие из нее, которые в совокупности удовлетворяют потребности компаний, работающих в этой сфере.

Подготовка к новому

Вакцины на основе мРНК против COVID-19 лишь первое из множества чудес, которые будут созданы биоэкономикой завтрашнего дня. Последнее заявление кажется вам далеким от реальности? История показывает, что это не так. 17 мая 1877 г. Александр Грэм Белл и Томас Уотсон стояли на сцене Чикеринг-холла в Нью-Йорке, демонстрируя трем сотням собравшихся диковинную конструкцию из дерева и металла. Долгие годы изобретатели усердно пытались решить задачу, которая в те времена представлялась крайне далекой от жизни: как передать человеческий голос с помощью электрических импульсов телеграфного провода. В итоге они соорудили приемник и мембрану, которые преобразовывали речь в электрические импульсы, а затем превращали импульсы обратно в речь.

В Чикеринг-холле состоялась первая наглядная презентация новой технологии. Авторы ее рассказали публике, что провод соединяет их изобретение с устройством в Нью Брансуике (штат Нью-Джерси) и с другим устройством в Нью Йорке, у которого человек глубоким баритоном пел известный псалом «Божьи воины, смотрите…» («Hold the Fort»). Белл рассказал об изобретении и обеспечивающих его работу нехитрых соединениях, и собравшиеся внезапно услышали невидимого певца. Некоторые зрители, убежденные, что «говорящий телефон» не более чем искусный трюк, шумно требовали обыскать помещение и найти вокалиста. Белл продолжил демонстрацию и прочитал обстоятельную лекцию с подробным объяснением электрической конструкции и теории звука. Его объяснение, а также экскурсия за кулисы в итоге убедили сомневающихся в том, что телефон настоящий.

Потребовалось несколько лет, чтобы предприниматели осознали ценность этой революционной технологии, однако со временем появились десятки предприятий, изготавливающих продукцию для удовлетворения потребностей новой телефонной отрасли: системы общих батарей, металлические контуры, кабели, переключатели, переносные и настенные телефонные аппараты, проектировка сетей для телефонных станций, огромные антенны для передачи телефонных сигналов и компании по их установке, коммутаторы и операторы, инженерные сети для производства и распределения электроэнергии, даже специализированные кустарные фирмы, которые украшали яркими гирляндами и флагами первые конструкции телефонных станций — леса, соединяющие провода с заземленными столбами.

Молодая индустрия

Синтетическая биология сейчас находится на том же этапе развития, что и «говорящий телефон» в Чикеринг-холле. Она существует. Она работает. Но обширные сети обеспечивающих поддержку ее и связанных с ней предприятий, компаний и второстепенных игроков еще только предстоит создать. Когда-нибудь мы придем к тому, что синтетическая биология будет считаться универсальной технологией. Как и в случае с телефоном и интернетом, ценность синтетической биологии для общества выйдет далеко за те рамки, которые мы сегодня можем себе представить.

Но первые показатели уже есть: в январе 2020 г. национальные академии наук, инженерного дела и медицины опубликовали исчерпывающее исследование, в котором доля биоэкономики в ВВП США оценивается в 5%, что составляет более $950 млрд. (Это было еще до начала пандемии COVID-19 и до прогресса в области синтетической биологии, достигнутого такими компаниями, как Moderna, что в основном является закономерным следствием). В исследовании McKinsey, проведенном в мае 2020 г., проанализировано влияние на мировую экономику 400 новаторских разработок, относящихся к синтетической биологии и находящихся на стадии подготовки, и определено, что за период с настоящего времени и до 2040 г. эти новшества могут в среднем ежегодно давать $4 трлн дохода. И в такой сумме не учтены все косвенные финансовые эффекты от смежных предприятий, услуг и продуктов, которые неизбежно появятся при становлении отрасли.

Развитие этих косвенных эффектов и есть то, что сегодня называют сетью создания стоимости. <…> Сеть создания стоимости синтетической биологии только начинает формироваться. Несмотря на то что реакция этого сектора на COVID-19 ускорила рост, пока в каждом его сегменте всего по нескольку игроков. Но ситуация быстро меняется. В 2020 г. инвесторы вложили в стартапы синтетической биологии $8 млрд. Этот объем финансирования не особо впечатляет, если учесть, что оценка компании Bytedance, создателя TikTok, в начале 2021 г. приближалась к цифре $400 млрд однако ежегодно, начиная с 2018 г., темпы роста инвестиций в синтетическую биологию удваивались.

Сейчас существуют биржевые инвестиционные фонды (ETF), полностью состоящие из акций биотехнологических компаний. Всего несколько лет назад таких фондов не было. В октябре 2020 г. BlackRock, компания-тяжеловес в сфере управления инвестициями, инициировала ETF для синтетической биологии, последовав примеру ARK Capital Management и Franklin Templeton, чьи ETF показали лучшие результаты, чем ожидалось. В 2019 г. ARK получила 44% прибыли от инвестиций, а в 2020 г. — ошеломляющие 210%. Медианный размер сделок при первом публичном предложении акций компаний синтетической биологии также растет: в 2020 г. в среднем первое публичное предложение оценивалось в два раза выше, чем в 2019-м.